Servidor Galaxy
Descripción del componente
Galaxy
Galaxy es una plataforma web ampliamente utilizada para realizar investigaciones de índole bioinformátiico teniendo como principal objetivo que estas sean accesibles, reproducibles y transparentes. Galaxy proporciona una interfaz fácil de usar para que los investigadores puedan ejecutar una amplia gama de tareas y flujos sin necesidad de tengan conocimientos avanzados de programación.
El proyecto UseGalaxy cuenta con el respaldo de una gran cantidad de servidores a lo largo de todo el mundo. Los principales servidores públicos de incluyen:
Galaxy Main: Instancia principal alojada en Penn State University (usegalaxy.org).
Galaxy Europe: Instancia europea alojada en Friburgo, Alemania (usegalaxy.eu).
Galaxy Australia: Instancia australiana alojada en Melbourne (usegalaxy.org.au).
Además, hay muchas otras instancias de Galaxy alojadas por instituciones y grupos de investigación a nivel mundial, lo que contribuye a un rico ecosistema de servidores Galaxy.
Dentro de IMPaCT-Data se ha desarrollado un ecosistema Galaxy compuesto de un nodo central (https://galaxy.impact-data.bsc.es/) y una serie de nodos externos de trabajo Pulsar.
Documentación técnica
Instalación de Galaxy
La implementación de la instancia UseGalaxy para IMPaCT-Data se realiza a través de Ansible. Esto implica automatizar el proceso de instalación y configuración para garantizar la coherencia y la repetibilidad.
Aunque IMPaCT-Data WP2 proporciona unas recetas de implementación, es importante tener en cuenta que los requisitos para una implementación exitosa de UseGalaxy pueden variar de un nodo a otro. Para ir paso a paso a través del proceso de un servidor UseGalaxy, los siguientes tutoriales prácticos oficiales:
Repositorio de código
Contacto
Para cualquier duda durante el periodo de uso y validación de los componentes de la Implementación de Referencia de IMPaCT-Data (Marzo, 2025), podéis poneros en contacto con: